Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD2P62316 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms