Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL2P60520 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL2P60520 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL2P60520 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms