Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD4P55036 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms