Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PMS1P54277 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PMS1P54277 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PMS1P54277 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PMS1P54277 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PMS1P54277 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PMS1P54277 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PMS1P54277 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PMS1P54277 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PMS1P54277 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PMS1P54277 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PMS1P54277 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PMS1P54277 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PMS1P54277 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PMS1P54277 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PMS1P54277 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMS1P54277 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMS1P54277 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMS1P54277 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMS1P54277 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMS1P54277 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMS1P54277 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMS1P54277 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMS1P54277 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMS1P54277 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMS1P54277 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PMS1P54277 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMS1P54277 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMS1P54277 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMS1P54277 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMS1P54277 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMS1P54277 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMS1P54277 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMS1P54277 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMS1P54277 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMS1P54277 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMS1P54277 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMS1P54277 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMS1P54277 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMS1P54277 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMS1P54277 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMS1P54277 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PMS1P54277 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PMS1P54277 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMS1P54277 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMS1P54277 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMS1P54277 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMS1P54277 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMS1P54277 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMS1P54277 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMS1P54277 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMS1P54277 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMS1P54277 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PMS1P54277 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PMS1P54277 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PMS1P54277 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PMS1P54277 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMS1P54277 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMS1P54277 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMS1P54277 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PMS1P54277 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS1P54277 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS1P54277 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS1P54277 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS1P54277 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS1P54277 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS1P54277 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS1P54277 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS1P54277 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS1P54277 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PMS1P54277 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMS1P54277 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMS1P54277 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMS1P54277 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMS1P54277 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS1P54277 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS1P54277 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS1P54277 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS1P54277 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS1P54277 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS1P54277 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMS1P54277 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMS1P54277 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMS1P54277 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMS1P54277 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMS1P54277 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMS1P54277 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMS1P54277 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMS1P54277 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMS1P54277 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMS1P54277 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMS1P54277 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMS1P54277 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMS1P54277 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PMS1P54277 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMS1P54277 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMS1P54277 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMS1P54277 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMS1P54277 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PMS1P54277 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms