Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGGT1BP53609 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGGT1BP53609 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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