Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF135P52742 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF135P52742 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF135P52742 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms