Protein–RNA interactions for Protein: P51793

CLCN4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4P51793 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLCN4P51793 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN4P51793 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN4P51793 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms