Protein–RNA interactions for Protein: P51511

MMP15, Matrix metalloproteinase-15, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP15P51511 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP15P51511 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP15P51511 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP15P51511 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP15P51511 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP15P51511 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP15P51511 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP15P51511 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP15P51511 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP15P51511 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP15P51511 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP15P51511 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP15P51511 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP15P51511 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP15P51511 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP15P51511 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP15P51511 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP15P51511 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP15P51511 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP15P51511 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP15P51511 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP15P51511 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP15P51511 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP15P51511 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP15P51511 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP15P51511 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP15P51511 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP15P51511 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP15P51511 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP15P51511 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP15P51511 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP15P51511 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP15P51511 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP15P51511 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP15P51511 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP15P51511 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP15P51511 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP15P51511 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP15P51511 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP15P51511 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP15P51511 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP15P51511 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP15P51511 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP15P51511 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP15P51511 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP15P51511 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP15P51511 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP15P51511 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP15P51511 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP15P51511 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP15P51511 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP15P51511 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP15P51511 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP15P51511 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP15P51511 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP15P51511 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP15P51511 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP15P51511 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP15P51511 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP15P51511 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP15P51511 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP15P51511 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP15P51511 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP15P51511 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP15P51511 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP15P51511 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP15P51511 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP15P51511 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP15P51511 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP15P51511 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP15P51511 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP15P51511 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP15P51511 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP15P51511 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP15P51511 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP15P51511 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP15P51511 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP15P51511 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP15P51511 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP15P51511 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP15P51511 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP15P51511 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP15P51511 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP15P51511 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP15P51511 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP15P51511 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP15P51511 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms