Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR4P46093 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR4P46093 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR4P46093 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR4P46093 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR4P46093 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR4P46093 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR4P46093 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR4P46093 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR4P46093 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR4P46093 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR4P46093 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR4P46093 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR4P46093 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR4P46093 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR4P46093 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR4P46093 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR4P46093 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR4P46093 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR4P46093 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR4P46093 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR4P46093 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR4P46093 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR4P46093 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR4P46093 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR4P46093 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR4P46093 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR4P46093 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR4P46093 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR4P46093 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR4P46093 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR4P46093 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR4P46093 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR4P46093 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR4P46093 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR4P46093 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR4P46093 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR4P46093 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR4P46093 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR4P46093 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR4P46093 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR4P46093 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR4P46093 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR4P46093 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR4P46093 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR4P46093 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR4P46093 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR4P46093 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR4P46093 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR4P46093 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR4P46093 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR4P46093 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR4P46093 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR4P46093 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR4P46093 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPR4P46093 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPR4P46093 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR4P46093 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR4P46093 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR4P46093 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR4P46093 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR4P46093 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR4P46093 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR4P46093 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR4P46093 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR4P46093 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR4P46093 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR4P46093 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR4P46093 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPR4P46093 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPR4P46093 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPR4P46093 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR4P46093 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR4P46093 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR4P46093 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR4P46093 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR4P46093 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR4P46093 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR4P46093 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR4P46093 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR4P46093 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR4P46093 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR4P46093 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR4P46093 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR4P46093 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR4P46093 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR4P46093 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR4P46093 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR4P46093 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR4P46093 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR4P46093 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR4P46093 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR4P46093 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR4P46093 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR4P46093 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR4P46093 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR4P46093 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR4P46093 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR4P46093 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR4P46093 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms