Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP2P42575 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP2P42575 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP2P42575 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP2P42575 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP2P42575 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP2P42575 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP2P42575 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP2P42575 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP2P42575 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP2P42575 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP2P42575 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP2P42575 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP2P42575 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP2P42575 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP2P42575 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP2P42575 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP2P42575 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP2P42575 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP2P42575 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP2P42575 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP2P42575 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP2P42575 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP2P42575 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP2P42575 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP2P42575 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP2P42575 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP2P42575 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP2P42575 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP2P42575 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP2P42575 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP2P42575 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP2P42575 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP2P42575 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP2P42575 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP2P42575 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP2P42575 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP2P42575 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP2P42575 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP2P42575 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP2P42575 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP2P42575 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP2P42575 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP2P42575 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP2P42575 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP2P42575 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP2P42575 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP2P42575 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP2P42575 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP2P42575 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP2P42575 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP2P42575 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP2P42575 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP2P42575 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP2P42575 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP2P42575 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP2P42575 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP2P42575 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP2P42575 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP2P42575 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP2P42575 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP2P42575 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP2P42575 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP2P42575 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP2P42575 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP2P42575 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP2P42575 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP2P42575 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP2P42575 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP2P42575 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP2P42575 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP2P42575 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP2P42575 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP2P42575 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP2P42575 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms