Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTR1BP42025 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTR1BP42025 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR1BP42025 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTR1BP42025 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms