Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNFP41002 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNFP41002 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNFP41002 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNFP41002 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNFP41002 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNFP41002 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNFP41002 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNFP41002 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNFP41002 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNFP41002 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNFP41002 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNFP41002 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNFP41002 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNFP41002 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNFP41002 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNFP41002 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNFP41002 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNFP41002 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNFP41002 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNFP41002 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNFP41002 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNFP41002 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNFP41002 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNFP41002 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNFP41002 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNFP41002 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNFP41002 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNFP41002 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNFP41002 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNFP41002 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNFP41002 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNFP41002 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNFP41002 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNFP41002 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNFP41002 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNFP41002 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNFP41002 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNFP41002 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNFP41002 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNFP41002 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNFP41002 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNFP41002 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNFP41002 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNFP41002 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNFP41002 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNFP41002 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNFP41002 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNFP41002 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNFP41002 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNFP41002 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNFP41002 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNFP41002 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNFP41002 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNFP41002 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNFP41002 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNFP41002 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNFP41002 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNFP41002 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNFP41002 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNFP41002 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNFP41002 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNFP41002 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNFP41002 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNFP41002 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNFP41002 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNFP41002 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNFP41002 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNFP41002 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNFP41002 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNFP41002 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNFP41002 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNFP41002 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNFP41002 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNFP41002 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNFP41002 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNFP41002 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNFP41002 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNFP41002 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNFP41002 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNFP41002 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNFP41002 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNFP41002 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNFP41002 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNFP41002 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNFP41002 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNFP41002 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNFP41002 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNFP41002 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNFP41002 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNFP41002 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNFP41002 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNFP41002 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNFP41002 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNFP41002 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNFP41002 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNFP41002 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNFP41002 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNFP41002 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNFP41002 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms