Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH5P33151 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH5P33151 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH5P33151 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH5P33151 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH5P33151 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH5P33151 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH5P33151 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH5P33151 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH5P33151 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH5P33151 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH5P33151 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH5P33151 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH5P33151 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH5P33151 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH5P33151 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH5P33151 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH5P33151 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH5P33151 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH5P33151 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH5P33151 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH5P33151 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH5P33151 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH5P33151 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH5P33151 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH5P33151 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH5P33151 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH5P33151 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH5P33151 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH5P33151 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH5P33151 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH5P33151 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH5P33151 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH5P33151 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH5P33151 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH5P33151 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH5P33151 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH5P33151 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH5P33151 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH5P33151 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH5P33151 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH5P33151 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH5P33151 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH5P33151 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH5P33151 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH5P33151 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH5P33151 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH5P33151 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH5P33151 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH5P33151 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH5P33151 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH5P33151 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH5P33151 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH5P33151 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH5P33151 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH5P33151 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH5P33151 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH5P33151 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDH5P33151 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDH5P33151 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH5P33151 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH5P33151 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH5P33151 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH5P33151 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH5P33151 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH5P33151 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH5P33151 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH5P33151 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH5P33151 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH5P33151 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH5P33151 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH5P33151 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH5P33151 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH5P33151 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH5P33151 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH5P33151 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH5P33151 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH5P33151 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH5P33151 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH5P33151 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH5P33151 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH5P33151 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH5P33151 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH5P33151 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH5P33151 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH5P33151 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH5P33151 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH5P33151 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH5P33151 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH5P33151 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH5P33151 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH5P33151 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH5P33151 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH5P33151 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH5P33151 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH5P33151 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH5P33151 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH5P33151 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH5P33151 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH5P33151 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms