Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNA8P32881 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNA8P32881 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms