Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2E2P29084 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E2P29084 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms