Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLD1P28340 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
POLD1P28340 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
POLD1P28340 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLD1P28340 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLD1P28340 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLD1P28340 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLD1P28340 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
POLD1P28340 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLD1P28340 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLD1P28340 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
POLD1P28340 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
POLD1P28340 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
POLD1P28340 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
POLD1P28340 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLD1P28340 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLD1P28340 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLD1P28340 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLD1P28340 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLD1P28340 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLD1P28340 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
POLD1P28340 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLD1P28340 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLD1P28340 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLD1P28340 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLD1P28340 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLD1P28340 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLD1P28340 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
POLD1P28340 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
POLD1P28340 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLD1P28340 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLD1P28340 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
POLD1P28340 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLD1P28340 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
POLD1P28340 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLD1P28340 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLD1P28340 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLD1P28340 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLD1P28340 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLD1P28340 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLD1P28340 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLD1P28340 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
POLD1P28340 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
POLD1P28340 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLD1P28340 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLD1P28340 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLD1P28340 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLD1P28340 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLD1P28340 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLD1P28340 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POLD1P28340 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLD1P28340 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLD1P28340 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLD1P28340 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLD1P28340 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLD1P28340 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLD1P28340 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLD1P28340 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLD1P28340 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLD1P28340 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
POLD1P28340 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLD1P28340 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
POLD1P28340 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
POLD1P28340 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLD1P28340 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLD1P28340 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
POLD1P28340 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
POLD1P28340 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLD1P28340 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLD1P28340 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLD1P28340 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLD1P28340 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLD1P28340 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLD1P28340 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLD1P28340 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
POLD1P28340 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLD1P28340 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLD1P28340 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLD1P28340 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLD1P28340 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLD1P28340 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLD1P28340 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLD1P28340 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLD1P28340 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLD1P28340 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLD1P28340 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLD1P28340 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLD1P28340 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLD1P28340 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
POLD1P28340 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLD1P28340 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLD1P28340 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLD1P28340 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLD1P28340 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLD1P28340 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLD1P28340 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLD1P28340 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLD1P28340 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLD1P28340 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLD1P28340 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms