Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA3P25788 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms