Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRHP20396 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
TRHP20396 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRHP20396 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRHP20396 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRHP20396 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRHP20396 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRHP20396 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRHP20396 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRHP20396 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TRHP20396 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TRHP20396 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TRHP20396 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TRHP20396 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TRHP20396 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
TRHP20396 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRHP20396 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRHP20396 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRHP20396 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
TRHP20396 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRHP20396 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TRHP20396 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TRHP20396 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
TRHP20396 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRHP20396 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TRHP20396 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TRHP20396 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
TRHP20396 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TRHP20396 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TRHP20396 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TRHP20396 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRHP20396 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRHP20396 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
TRHP20396 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
TRHP20396 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
TRHP20396 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TRHP20396 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC39■■■■□ 3.83
TRHP20396 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TRHP20396 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRHP20396 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRHP20396 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRHP20396 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRHP20396 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
TRHP20396 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRHP20396 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRHP20396 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRHP20396 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
TRHP20396 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
TRHP20396 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRHP20396 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRHP20396 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRHP20396 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
TRHP20396 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRHP20396 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRHP20396 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRHP20396 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRHP20396 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRHP20396 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRHP20396 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRHP20396 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRHP20396 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRHP20396 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRHP20396 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRHP20396 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRHP20396 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRHP20396 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRHP20396 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRHP20396 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRHP20396 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
TRHP20396 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
TRHP20396 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
TRHP20396 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
TRHP20396 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRHP20396 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TRHP20396 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
TRHP20396 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
TRHP20396 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
TRHP20396 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TRHP20396 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRHP20396 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRHP20396 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRHP20396 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRHP20396 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TRHP20396 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TRHP20396 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TRHP20396 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TRHP20396 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TRHP20396 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TRHP20396 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TRHP20396 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TRHP20396 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TRHP20396 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TRHP20396 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TRHP20396 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TRHP20396 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
TRHP20396 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TRHP20396 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
TRHP20396 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
TRHP20396 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TRHP20396 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms