Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNA2P20248 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA2P20248 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms