Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB9P17482 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB9P17482 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms