Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STMN1P16949 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STMN1P16949 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STMN1P16949 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STMN1P16949 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STMN1P16949 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STMN1P16949 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STMN1P16949 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STMN1P16949 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STMN1P16949 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STMN1P16949 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STMN1P16949 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STMN1P16949 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STMN1P16949 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STMN1P16949 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STMN1P16949 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STMN1P16949 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STMN1P16949 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STMN1P16949 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STMN1P16949 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STMN1P16949 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STMN1P16949 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STMN1P16949 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STMN1P16949 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STMN1P16949 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STMN1P16949 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STMN1P16949 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STMN1P16949 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STMN1P16949 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STMN1P16949 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STMN1P16949 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STMN1P16949 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STMN1P16949 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STMN1P16949 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STMN1P16949 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STMN1P16949 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STMN1P16949 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STMN1P16949 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STMN1P16949 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STMN1P16949 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STMN1P16949 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STMN1P16949 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STMN1P16949 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STMN1P16949 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STMN1P16949 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STMN1P16949 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STMN1P16949 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STMN1P16949 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STMN1P16949 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STMN1P16949 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STMN1P16949 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STMN1P16949 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STMN1P16949 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STMN1P16949 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STMN1P16949 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STMN1P16949 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STMN1P16949 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STMN1P16949 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STMN1P16949 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STMN1P16949 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STMN1P16949 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STMN1P16949 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STMN1P16949 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STMN1P16949 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STMN1P16949 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STMN1P16949 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STMN1P16949 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STMN1P16949 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STMN1P16949 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STMN1P16949 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STMN1P16949 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STMN1P16949 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STMN1P16949 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STMN1P16949 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STMN1P16949 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STMN1P16949 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STMN1P16949 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STMN1P16949 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STMN1P16949 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STMN1P16949 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STMN1P16949 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STMN1P16949 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STMN1P16949 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STMN1P16949 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STMN1P16949 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STMN1P16949 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STMN1P16949 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STMN1P16949 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STMN1P16949 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STMN1P16949 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STMN1P16949 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STMN1P16949 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STMN1P16949 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STMN1P16949 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STMN1P16949 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STMN1P16949 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STMN1P16949 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STMN1P16949 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STMN1P16949 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STMN1P16949 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms