Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FDPSP14324 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FDPSP14324 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FDPSP14324 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FDPSP14324 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDPSP14324 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDPSP14324 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FDPSP14324 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDPSP14324 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDPSP14324 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDPSP14324 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FDPSP14324 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDPSP14324 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDPSP14324 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDPSP14324 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDPSP14324 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDPSP14324 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDPSP14324 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FDPSP14324 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FDPSP14324 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FDPSP14324 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FDPSP14324 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FDPSP14324 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FDPSP14324 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FDPSP14324 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FDPSP14324 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FDPSP14324 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FDPSP14324 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FDPSP14324 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FDPSP14324 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FDPSP14324 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FDPSP14324 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FDPSP14324 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FDPSP14324 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FDPSP14324 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FDPSP14324 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FDPSP14324 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FDPSP14324 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FDPSP14324 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FDPSP14324 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FDPSP14324 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FDPSP14324 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FDPSP14324 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FDPSP14324 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FDPSP14324 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FDPSP14324 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FDPSP14324 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FDPSP14324 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FDPSP14324 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FDPSP14324 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FDPSP14324 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FDPSP14324 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FDPSP14324 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDPSP14324 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDPSP14324 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDPSP14324 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDPSP14324 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDPSP14324 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDPSP14324 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FDPSP14324 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FDPSP14324 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FDPSP14324 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FDPSP14324 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FDPSP14324 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FDPSP14324 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FDPSP14324 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FDPSP14324 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FDPSP14324 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FDPSP14324 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FDPSP14324 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FDPSP14324 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FDPSP14324 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FDPSP14324 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FDPSP14324 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FDPSP14324 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDPSP14324 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FDPSP14324 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FDPSP14324 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FDPSP14324 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FDPSP14324 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FDPSP14324 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FDPSP14324 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FDPSP14324 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FDPSP14324 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FDPSP14324 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDPSP14324 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDPSP14324 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDPSP14324 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDPSP14324 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FDPSP14324 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FDPSP14324 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FDPSP14324 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FDPSP14324 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FDPSP14324 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FDPSP14324 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FDPSP14324 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FDPSP14324 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FDPSP14324 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDPSP14324 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDPSP14324 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms