Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPB41P11171 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPB41P11171 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPB41P11171 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPB41P11171 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPB41P11171 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPB41P11171 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPB41P11171 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPB41P11171 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPB41P11171 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPB41P11171 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPB41P11171 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPB41P11171 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPB41P11171 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPB41P11171 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPB41P11171 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPB41P11171 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPB41P11171 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPB41P11171 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPB41P11171 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPB41P11171 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPB41P11171 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPB41P11171 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPB41P11171 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPB41P11171 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPB41P11171 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EPB41P11171 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPB41P11171 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPB41P11171 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPB41P11171 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPB41P11171 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPB41P11171 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPB41P11171 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EPB41P11171 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EPB41P11171 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EPB41P11171 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPB41P11171 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPB41P11171 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPB41P11171 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EPB41P11171 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPB41P11171 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPB41P11171 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPB41P11171 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPB41P11171 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPB41P11171 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPB41P11171 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPB41P11171 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPB41P11171 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPB41P11171 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPB41P11171 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPB41P11171 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPB41P11171 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPB41P11171 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41P11171 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41P11171 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41P11171 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41P11171 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41P11171 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41P11171 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41P11171 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPB41P11171 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPB41P11171 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPB41P11171 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPB41P11171 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPB41P11171 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPB41P11171 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPB41P11171 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPB41P11171 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPB41P11171 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPB41P11171 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPB41P11171 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPB41P11171 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPB41P11171 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPB41P11171 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPB41P11171 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPB41P11171 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPB41P11171 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPB41P11171 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPB41P11171 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPB41P11171 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPB41P11171 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPB41P11171 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EPB41P11171 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPB41P11171 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EPB41P11171 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPB41P11171 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPB41P11171 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPB41P11171 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPB41P11171 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPB41P11171 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPB41P11171 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPB41P11171 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPB41P11171 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPB41P11171 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EPB41P11171 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EPB41P11171 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPB41P11171 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPB41P11171 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EPB41P11171 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPB41P11171 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms