Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00271P0C7V0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00271P0C7V0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms