Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL3P08700 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL3P08700 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL3P08700 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL3P08700 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL3P08700 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IL3P08700 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL3P08700 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL3P08700 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL3P08700 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL3P08700 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IL3P08700 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IL3P08700 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IL3P08700 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL3P08700 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL3P08700 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL3P08700 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL3P08700 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL3P08700 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL3P08700 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL3P08700 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL3P08700 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL3P08700 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL3P08700 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL3P08700 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL3P08700 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL3P08700 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IL3P08700 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL3P08700 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL3P08700 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL3P08700 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL3P08700 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL3P08700 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IL3P08700 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL3P08700 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL3P08700 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL3P08700 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL3P08700 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL3P08700 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL3P08700 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL3P08700 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL3P08700 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL3P08700 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL3P08700 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IL3P08700 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL3P08700 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL3P08700 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL3P08700 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL3P08700 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL3P08700 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL3P08700 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL3P08700 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL3P08700 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL3P08700 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL3P08700 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL3P08700 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL3P08700 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL3P08700 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL3P08700 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL3P08700 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL3P08700 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL3P08700 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IL3P08700 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL3P08700 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL3P08700 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL3P08700 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL3P08700 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL3P08700 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL3P08700 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL3P08700 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL3P08700 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL3P08700 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL3P08700 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL3P08700 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL3P08700 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL3P08700 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL3P08700 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL3P08700 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL3P08700 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL3P08700 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL3P08700 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IL3P08700 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL3P08700 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
IL3P08700 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL3P08700 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL3P08700 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL3P08700 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL3P08700 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms