Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP3A4P08684 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CYP3A4P08684 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CYP3A4P08684 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP3A4P08684 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP3A4P08684 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP3A4P08684 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP3A4P08684 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP3A4P08684 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CYP3A4P08684 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CYP3A4P08684 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP3A4P08684 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP3A4P08684 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP3A4P08684 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP3A4P08684 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP3A4P08684 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP3A4P08684 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP3A4P08684 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP3A4P08684 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CYP3A4P08684 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP3A4P08684 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP3A4P08684 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP3A4P08684 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP3A4P08684 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CYP3A4P08684 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP3A4P08684 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP3A4P08684 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CYP3A4P08684 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYP3A4P08684 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP3A4P08684 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP3A4P08684 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP3A4P08684 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP3A4P08684 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP3A4P08684 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP3A4P08684 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP3A4P08684 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP3A4P08684 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP3A4P08684 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CYP3A4P08684 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP3A4P08684 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP3A4P08684 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms