Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP1A1P05023 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP1A1P05023 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP1A1P05023 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms