Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTAP01040 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTAP01040 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTAP01040 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTAP01040 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTAP01040 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTAP01040 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTAP01040 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTAP01040 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTAP01040 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTAP01040 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTAP01040 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTAP01040 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTAP01040 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTAP01040 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTAP01040 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTAP01040 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTAP01040 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTAP01040 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTAP01040 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTAP01040 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTAP01040 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTAP01040 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTAP01040 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTAP01040 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTAP01040 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTAP01040 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTAP01040 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTAP01040 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTAP01040 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTAP01040 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTAP01040 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTAP01040 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTAP01040 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTAP01040 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTAP01040 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTAP01040 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTAP01040 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTAP01040 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTAP01040 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTAP01040 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTAP01040 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTAP01040 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSTAP01040 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTAP01040 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTAP01040 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTAP01040 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTAP01040 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTAP01040 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTAP01040 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTAP01040 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTAP01040 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTAP01040 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTAP01040 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTAP01040 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTAP01040 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTAP01040 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTAP01040 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSTAP01040 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTAP01040 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTAP01040 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTAP01040 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTAP01040 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTAP01040 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTAP01040 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTAP01040 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTAP01040 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSTAP01040 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTAP01040 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTAP01040 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTAP01040 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTAP01040 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTAP01040 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSTAP01040 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTAP01040 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTAP01040 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTAP01040 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSTAP01040 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTAP01040 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTAP01040 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSTAP01040 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTAP01040 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTAP01040 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTAP01040 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTAP01040 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTAP01040 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSTAP01040 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTAP01040 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTAP01040 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTAP01040 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTAP01040 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTAP01040 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTAP01040 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTAP01040 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTAP01040 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSTAP01040 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTAP01040 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTAP01040 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTAP01040 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTAP01040 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms