Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFDP00746 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFDP00746 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFDP00746 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFDP00746 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFDP00746 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFDP00746 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFDP00746 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFDP00746 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFDP00746 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFDP00746 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFDP00746 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFDP00746 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFDP00746 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFDP00746 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFDP00746 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFDP00746 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFDP00746 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFDP00746 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFDP00746 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CFDP00746 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CFDP00746 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFDP00746 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFDP00746 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFDP00746 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFDP00746 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFDP00746 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFDP00746 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFDP00746 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFDP00746 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFDP00746 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CFDP00746 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFDP00746 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFDP00746 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFDP00746 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFDP00746 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFDP00746 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFDP00746 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFDP00746 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFDP00746 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFDP00746 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFDP00746 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFDP00746 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFDP00746 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFDP00746 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFDP00746 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFDP00746 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFDP00746 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFDP00746 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFDP00746 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFDP00746 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFDP00746 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFDP00746 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFDP00746 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFDP00746 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFDP00746 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFDP00746 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFDP00746 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CFDP00746 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFDP00746 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFDP00746 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFDP00746 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFDP00746 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFDP00746 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFDP00746 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFDP00746 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFDP00746 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFDP00746 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFDP00746 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFDP00746 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFDP00746 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFDP00746 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFDP00746 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFDP00746 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFDP00746 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFDP00746 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFDP00746 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFDP00746 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFDP00746 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFDP00746 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFDP00746 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFDP00746 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFDP00746 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFDP00746 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFDP00746 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFDP00746 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CFDP00746 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFDP00746 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFDP00746 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFDP00746 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFDP00746 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFDP00746 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFDP00746 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFDP00746 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFDP00746 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CFDP00746 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFDP00746 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFDP00746 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFDP00746 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CFDP00746 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms