Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCNTO95613 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCNTO95613 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCNTO95613 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCNTO95613 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCNTO95613 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNTO95613 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNTO95613 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNTO95613 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNTO95613 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNTO95613 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNTO95613 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNTO95613 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNTO95613 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCNTO95613 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCNTO95613 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCNTO95613 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCNTO95613 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCNTO95613 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCNTO95613 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCNTO95613 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCNTO95613 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCNTO95613 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCNTO95613 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCNTO95613 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNTO95613 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PCNTO95613 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PCNTO95613 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PCNTO95613 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNTO95613 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PCNTO95613 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNTO95613 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCNTO95613 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCNTO95613 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCNTO95613 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PCNTO95613 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PCNTO95613 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCNTO95613 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PCNTO95613 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCNTO95613 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCNTO95613 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCNTO95613 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PCNTO95613 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCNTO95613 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCNTO95613 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCNTO95613 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNTO95613 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNTO95613 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNTO95613 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNTO95613 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNTO95613 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNTO95613 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCNTO95613 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCNTO95613 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCNTO95613 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCNTO95613 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCNTO95613 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCNTO95613 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCNTO95613 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCNTO95613 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCNTO95613 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCNTO95613 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCNTO95613 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCNTO95613 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCNTO95613 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCNTO95613 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCNTO95613 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCNTO95613 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCNTO95613 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCNTO95613 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PCNTO95613 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCNTO95613 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCNTO95613 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCNTO95613 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PCNTO95613 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PCNTO95613 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCNTO95613 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCNTO95613 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCNTO95613 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCNTO95613 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PCNTO95613 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCNTO95613 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCNTO95613 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCNTO95613 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PCNTO95613 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCNTO95613 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PCNTO95613 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCNTO95613 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCNTO95613 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCNTO95613 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCNTO95613 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCNTO95613 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCNTO95613 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCNTO95613 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCNTO95613 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCNTO95613 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCNTO95613 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCNTO95613 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCNTO95613 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCNTO95613 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms