Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYPD3O95274 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYPD3O95274 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms