Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT3O75175 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT3O75175 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT3O75175 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms