Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MITFO75030 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MITFO75030 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MITFO75030 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MITFO75030 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MITFO75030 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MITFO75030 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MITFO75030 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MITFO75030 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MITFO75030 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MITFO75030 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MITFO75030 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MITFO75030 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MITFO75030 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MITFO75030 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MITFO75030 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MITFO75030 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MITFO75030 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MITFO75030 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MITFO75030 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MITFO75030 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MITFO75030 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MITFO75030 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MITFO75030 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MITFO75030 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MITFO75030 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MITFO75030 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MITFO75030 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MITFO75030 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MITFO75030 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MITFO75030 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MITFO75030 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MITFO75030 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MITFO75030 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MITFO75030 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MITFO75030 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MITFO75030 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MITFO75030 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MITFO75030 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MITFO75030 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MITFO75030 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MITFO75030 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MITFO75030 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MITFO75030 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MITFO75030 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MITFO75030 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MITFO75030 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MITFO75030 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MITFO75030 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MITFO75030 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MITFO75030 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MITFO75030 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MITFO75030 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MITFO75030 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MITFO75030 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MITFO75030 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MITFO75030 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MITFO75030 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MITFO75030 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MITFO75030 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MITFO75030 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MITFO75030 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MITFO75030 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MITFO75030 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MITFO75030 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MITFO75030 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MITFO75030 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MITFO75030 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MITFO75030 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MITFO75030 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MITFO75030 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MITFO75030 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MITFO75030 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MITFO75030 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MITFO75030 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MITFO75030 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MITFO75030 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MITFO75030 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MITFO75030 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MITFO75030 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MITFO75030 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MITFO75030 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MITFO75030 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MITFO75030 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MITFO75030 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MITFO75030 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MITFO75030 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MITFO75030 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MITFO75030 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MITFO75030 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MITFO75030 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MITFO75030 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MITFO75030 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MITFO75030 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MITFO75030 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MITFO75030 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MITFO75030 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MITFO75030 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MITFO75030 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MITFO75030 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms