Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN3BO60391 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN3BO60391 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN3BO60391 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN3BO60391 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN3BO60391 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN3BO60391 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN3BO60391 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIN3BO60391 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN3BO60391 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms