Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCMT2O60294 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCMT2O60294 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCMT2O60294 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms