Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP9BO43861 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP9BO43861 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP9BO43861 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms