Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX6O43752 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX6O43752 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX6O43752 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX6O43752 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX6O43752 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
STX6O43752 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX6O43752 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STX6O43752 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STX6O43752 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STX6O43752 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STX6O43752 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
STX6O43752 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
STX6O43752 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
STX6O43752 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STX6O43752 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STX6O43752 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STX6O43752 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STX6O43752 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STX6O43752 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STX6O43752 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STX6O43752 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX6O43752 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
STX6O43752 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX6O43752 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX6O43752 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX6O43752 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX6O43752 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX6O43752 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX6O43752 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
STX6O43752 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
STX6O43752 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX6O43752 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX6O43752 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX6O43752 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX6O43752 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX6O43752 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX6O43752 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX6O43752 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX6O43752 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX6O43752 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX6O43752 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX6O43752 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX6O43752 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX6O43752 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
STX6O43752 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STX6O43752 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
STX6O43752 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STX6O43752 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX6O43752 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX6O43752 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX6O43752 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX6O43752 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX6O43752 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX6O43752 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX6O43752 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX6O43752 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX6O43752 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX6O43752 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX6O43752 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX6O43752 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
STX6O43752 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX6O43752 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX6O43752 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX6O43752 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX6O43752 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STX6O43752 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STX6O43752 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STX6O43752 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STX6O43752 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX6O43752 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STX6O43752 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX6O43752 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX6O43752 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX6O43752 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX6O43752 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX6O43752 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX6O43752 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX6O43752 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STX6O43752 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STX6O43752 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STX6O43752 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STX6O43752 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STX6O43752 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
STX6O43752 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
STX6O43752 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STX6O43752 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STX6O43752 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STX6O43752 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STX6O43752 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STX6O43752 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX6O43752 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX6O43752 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX6O43752 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX6O43752 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX6O43752 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX6O43752 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
STX6O43752 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
STX6O43752 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STX6O43752 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms