Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERI3O43414 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERI3O43414 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERI3O43414 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERI3O43414 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERI3O43414 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERI3O43414 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERI3O43414 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERI3O43414 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERI3O43414 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERI3O43414 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERI3O43414 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERI3O43414 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERI3O43414 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERI3O43414 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERI3O43414 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERI3O43414 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERI3O43414 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERI3O43414 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERI3O43414 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERI3O43414 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERI3O43414 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERI3O43414 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERI3O43414 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERI3O43414 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERI3O43414 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERI3O43414 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERI3O43414 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERI3O43414 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERI3O43414 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERI3O43414 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERI3O43414 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERI3O43414 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERI3O43414 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERI3O43414 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERI3O43414 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERI3O43414 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERI3O43414 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERI3O43414 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERI3O43414 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERI3O43414 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERI3O43414 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERI3O43414 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERI3O43414 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERI3O43414 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERI3O43414 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERI3O43414 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERI3O43414 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERI3O43414 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERI3O43414 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERI3O43414 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERI3O43414 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERI3O43414 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERI3O43414 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERI3O43414 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERI3O43414 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERI3O43414 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI3O43414 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI3O43414 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI3O43414 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI3O43414 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI3O43414 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI3O43414 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI3O43414 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI3O43414 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI3O43414 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI3O43414 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI3O43414 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI3O43414 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERI3O43414 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERI3O43414 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERI3O43414 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERI3O43414 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERI3O43414 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERI3O43414 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERI3O43414 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERI3O43414 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERI3O43414 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERI3O43414 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERI3O43414 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERI3O43414 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERI3O43414 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERI3O43414 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERI3O43414 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERI3O43414 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERI3O43414 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERI3O43414 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERI3O43414 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERI3O43414 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERI3O43414 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERI3O43414 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERI3O43414 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms