Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC3O15379 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC3O15379 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms