Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
N4BP3O15049 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4BP3O15049 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4BP3O15049 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
N4BP3O15049 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms