Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CITO14578 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CITO14578 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CITO14578 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CITO14578 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CITO14578 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CITO14578 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CITO14578 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CITO14578 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CITO14578 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CITO14578 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CITO14578 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CITO14578 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CITO14578 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CITO14578 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CITO14578 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CITO14578 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CITO14578 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CITO14578 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CITO14578 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CITO14578 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CITO14578 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CITO14578 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CITO14578 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CITO14578 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CITO14578 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CITO14578 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CITO14578 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CITO14578 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CITO14578 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CITO14578 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CITO14578 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CITO14578 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CITO14578 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CITO14578 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CITO14578 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CITO14578 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CITO14578 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CITO14578 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CITO14578 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CITO14578 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CITO14578 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CITO14578 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CITO14578 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CITO14578 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CITO14578 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CITO14578 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CITO14578 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CITO14578 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CITO14578 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CITO14578 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CITO14578 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CITO14578 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CITO14578 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CITO14578 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CITO14578 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CITO14578 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CITO14578 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CITO14578 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CITO14578 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CITO14578 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CITO14578 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CITO14578 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CITO14578 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CITO14578 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CITO14578 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CITO14578 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CITO14578 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CITO14578 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CITO14578 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CITO14578 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CITO14578 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CITO14578 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CITO14578 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CITO14578 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CITO14578 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CITO14578 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CITO14578 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CITO14578 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CITO14578 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CITO14578 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CITO14578 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CITO14578 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CITO14578 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CITO14578 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CITO14578 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CITO14578 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CITO14578 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CITO14578 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CITO14578 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CITO14578 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CITO14578 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CITO14578 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CITO14578 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CITO14578 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CITO14578 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CITO14578 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CITO14578 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CITO14578 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CITO14578 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms