Protein–RNA interactions for Protein: O14513

NCKAP5, Nck-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP5O14513 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP5O14513 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCKAP5O14513 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCKAP5O14513 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP5O14513 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP5O14513 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP5O14513 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms