Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFRA2O00451 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA2O00451 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms