Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B1O00203 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3B1O00203 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AP3B1O00203 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3B1O00203 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms