Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HHLA1C9JL84 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HHLA1C9JL84 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HHLA1C9JL84 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms