Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPBD1B2RD01 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBD1B2RD01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms