Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRR3A8MPY1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR3A8MPY1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms