Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SOBPA7XYQ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOBPA7XYQ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOBPA7XYQ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms