Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4orf47A7E2U8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf47A7E2U8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C4orf47A7E2U8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4orf47A7E2U8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms