Protein–RNA interactions for Protein: A6NLC5

C3orf70, UPF0524 protein C3orf70, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf70A6NLC5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C3orf70A6NLC5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf70A6NLC5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf70A6NLC5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf70A6NLC5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms